Sistem Biyotıbbi: insan hastalıklarına ağ tabanlı bir yaklaşım

Abstract

Sistem Biyotıbbı, bütüncül bir bakış açısı ile hastalıkların altında yatan mekanizmaları anlamak, yeni biyobelirteç ve terapötik hedefler belirlemek ve yeni ilaçlar tasarlamak için yeni nesil bir yaklaşımı ifade etmektedir. Bu kapsamda temel araçları hücresel ağlardır. Mikroarray veya yeni nesil sekanslama çalışmaları ile elde edilen karmaşık, boyutu yüksek ve bilinmeyeni fazla olan verilerin incelenmesi son yıllarda gen, protein kodlamayan RNA, epigenetik modifikasyonlar, protein, metabolit, biyolojik yolizleri seviyelerinde araştırmalar gerektirmekte ve bu sebeple sistem biyolojisi yada sistem biyotıbbı yaklaşımı, yöntem ve gereçlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu makalede yumurtalık kanseri vaka çalışması olarak ele alınarak omik verilerinin bütünleştirici analizlerine dayanan sistem biyotıbbı çalışmaları derlenmiştir.

Systems Biomedicine serves a new generation approach to understand the mechanisms behind disease pathogenesis, to identify new biomarkers and therapeutic targets, and to discover new drugs within a holistic point of view. The main tools in this context are cellular networks. Investigation of complex, high-throughput and unknown data obtained by microarray or next generation sequencing studies requires investigations in the levels of gene, non-protein coding RNA, epigenetic modifications, protein, metabolite and biological pathways. Therefore system biology or system biomedicine approach, method and algorithms are needed. Here, a review on integrative approaches of omics data within the systems biomedicine concept is presented handling ovarian cancer as a case study.

Sistem Biyotıbbı, bütüncül bir bakış açısı ile hastalıkların altında yatan mekanizmaları anlamak, yeni biyobelirteç ve terapötik hedefler belirlemek ve yeni ilaçlar tasarlamak için yeni nesil bir yaklaşımı ifade etmektedir. Bu kapsamda temel araçları hücresel ağlardır. Mikroarray veya yeni nesil sekanslama çalışmaları ile elde edilen karmaşık, boyutu yüksek ve bilinmeyeni fazla olan verilerin incelenmesi son yıllarda gen, protein kodlamayan RNA, epigenetik modifikasyonlar, protein, metabolit, biyolojik yolizleri seviyelerinde araştırmalar gerektirmekte ve bu sebeple sistem biyolojisi yada sistem biyotıbbı yaklaşımı, yöntem ve gereçlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu makalede yumurtalık kanseri vaka çalışması olarak ele alınarak omik verilerinin bütünleştirici analizlerine dayanan sistem biyotıbbı çalışmaları derlenmiştir